สำหรับโรงเรียนที่ร่วมโครงการวิจัยเพื่อยกระดับคุณภาพการจัดการเรียนการสอนด้านวิทยาศาสตร์ในคร้ังนี้ ประกอบด้วย 12 โรงเรียน ได้แก่ 1) โรงเรียนธรรมวิทยามูลนิธิ ต.สะเตง อ.เมือง 2) โรงเรียนพัฒนาอิสลามวิทยา ต.ลำใหม่ อ.เมือง 3) โรงเรียนสมบูรณ์ศาสน์ ต.ปะแตอ.ยะหา 4) โรงเรียนดำรงวิทยา ต.บันนังสตา อ.บันนังสตา 5) โรงเรียนมะอาหัดอิสลามียะห์ ต.บาลอ อ.รามัน 6) โรงเรียนสุทธิศาสน์วิทยา อ.บ้านแหร อ.ธารโต 7) โรงเรียนตาร์เบียตุลวาตันมูลนิธิ ต.บันนังสาเรง อ.เมือง 8) โรงเรียนประทีปวิทยา ต.ลิดล อ.เมือง 9) โรงเรียนคัมภีร์วิทยา ต.บันนังสตา อ.บันนังสตา 10) โรงเรียนสตรีอิสลามมูลนิธิ ต.สะเตง อ.เมือง 11) โรงเรียนดารูลฮูดาวิทยา ต.วังพญา อ.รามัน 12) โรงเรียนสุขสวัสดิ์วิทยา ต.บาโงยซิแน อ.ยะหา ซึ่งทั้ง 12 โรงเรียน มีการจัดทำ MoU ในโครงการจัดตั้งห้องเรียน SMP-YRU มาตั้งแต่ปีงบประมาณ พ.ศ. 2559 ดั้งนั้น การจัดทำแผนการวิจัยและโครงการวิจัยในครั้งนี้ นับเป็นการต่อยอดและขยายผล เพื่อการยกระดับคุณภาพการศึกษาในด้านวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ โดยการยกระดับด้วยการวิจัยพัฒนานวัตกรรมการจัดการเรียนรู้ในสามเรื่องหลักผ่านกระบวนการสร้างสังคมแห่งการเรียนรู้ทางวิชาชีพ (Professional Learning Coummunities: PLC) ได้แก่ การจัดการเรียนรู้ด้วย STEM Education การจัดการเรียนรู้โดยใช้โครงงานเป็นฐาน (Project-based Learning: PjBL) และการจัดการเรียนรู้ผ่านระบบอีเลิร์นนิ่ง (e-Learning)
1) โครงการวิจัยที่ 1 การพัฒนาการจัดการเรียนรู้แบบสะเต็มศึกษา ผ่านกระบวนการสร้างสังคมแห่งการเรียนรู้ทางวิชาชีพ Professional Learning Community (PLC) ในรายวิชาเคมี ส าหรับนักเรียนชั้ มัธยมศึกษาปีที่ 4 โครงการห้องเรียนพิเศษ SMP มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา โดยมีอาจารย์ปิยศิริ สุนทรนนท์ สินไชย เป็นหัวหน้าโครงการวิจัย และมีอาจารย์อลภา ทองไชย อาจารย์ ดร.วารุณี หะยีมะสาและ เป็นผู้ร่วมวิจัย
2) โครงการวิจัยที่ 2 การสร้างสังคมแห่งการเรียนรู้ทางวิชาชีพ Professional Learning Community (PLC) ในรายวิชาเคมี ส าหรับนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 4 โครงการห้องเรียนพิเศษ SMP มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลาผ่านกระบวนการจัดการเรียนรู้แบบใช้โครงงานเป็นฐาน โดยมี อาจารย์ปิยศิริ สุนทรนนท์ สินไชย เป็นหัวหน้าโครงการวิจัย และมี อาจารย์ ดร.นิสาพร มูหะมัด และ อาจารย์ปิยศิริ สุนทรนนท์ สินไชย และอาจารย์พูรกอนนี สาและ เป็นผู้ร่วมวิจัย
3) โครงการวิจัยที่ 3 การจัดการเรียนรู้โดยใช้บทเรียนอีเลิร์นนิ่งผ่านกระบวนการสร้างสังคมแห่งการเรียนรู้ทางวิชาชีพ Professional Learning Community (PLC) ในรายวิชาเคมี ส าหรับนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 4 โครงการห้องเรียนพิเศษ SMP มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา โดยมี อาจารย์ ดร.ศิริชัย นามบุรี เป็นหัวหน้าโครงการ
ผลที่คาดว่าจะเกิดขึ้นจากแผนงานวิจัยข้างต้น โรงเรียนในโครงการ SMP-YRU จะได้รูปแบบการจัดการเรียนรู้และสร้างเป็นชุมชนหรือสังคมแฟน่งการเรียนรู้ทางวิชาชีพ หรือ PLC สามารถนำมาเป็นต้นแบบขยายผลไปยังเนื้อหา รายวิชาอื่น ๆ และโรงเรียนอื่น ๆ ในพื้นที่จังหวัดชายแดนภาคใต้ อีกทั้งโครงการวิจัยภายใต้แผนการวิจัย ดำเนินการโดยเน้นกระบวนการมีส่วนร่วมและการพัฒนาไปพร้อมกันระหว่างมหาวิทยาลัย โครงการห้องเรียน SMP-YRU และการพัฒนาคุณภาพการศึกษาในโรงเรียนเอกชนสอนศาสนาควบคู่สามัญในพื้นที่ จชต.
